Apple PayのICOCAで発行されたICOCAとEX-ICカード等のICカードとを重ねて新幹線自動改札機を通過することはできません。
在来線から新幹線のお乗り継ぎをApple PayのICOCAでご利用いただく場合は、ご利用になりたいICOCAのICOCA番号をエクスプレス予約の交通系ICカードとして登録いただければ、新幹線自動改札機を通過することができます。
お乗り継ぎ方法の詳細はこちらをご確認ください。